Un arbre indigène est un arbre qui vit dans une région colonisée par sa propre espèce, sans aide humaine. On appelle ces régions des aires de répartition naturelle. Le bouleau à papier ou l'érable à sucre sont certainement parmi les meilleurs exemples d'arbres indigènes que nous ayons au Québec.
Dans la province, il y a environ une cinquantaine d'arbres qui sont indigènes, mais près d'une quinzaine d'entre eux atteignent la limite septentrionale de leur aire de répartition naturelle dans l'extrême-sud de la province. C'est le cas, par exemple, des caryers ovales et cordiformes, de l'érable noir, du micocoulier occidental, de l'orme liège, du genévrier de Virginie, du pin rigide, etc. À noter que le terme aire de répartition naturelle désigne une région donnée où vit et se reproduit une espèce végétale ou animale donnée. Celles-ci ne se préoccupent pas du tout des frontières politiques d'un état. Ainsi, lorsqu'on dit qu'une espèce est indigène au Québec, cela n'est pas forcément vrai, puisque souvent elle ne le sera, en vérité, que dans le sud de celui-ci. Par exemple, l'érable à sucre est indigène à Montréal, mais pas à Kuujjuaq.
On peut souligner au passage que les aires de répartition naturelles des végétaux sont sujet à changer au fil des années, des décennies, des siècles et des millénaires. Ainsi, des arbres qui ne sont pas indigènes aujourd'hui au Québec, l'ont peut-être déjà été jadis ou le seront peut-être un jour. L'aire de répartion d'une plante dépend de plusieurs facteurs. Le climat, le type de sol et l'altitude ne sont que quelques exemple parmi bien d'autres. Et comme ces choses sont en constante évolution, le fait qu'une plante est indigène ici, aujourd'hui, ne veut pas dire qu'elle le sera pour toujours et vice-versa.
Ici, les arbres indigènes sont séparés en deux sous-catégories; les angiospermes (feuillus) et les gymnospermes (conifères). Attention! Tous les conifères sont des gymnospermes, mais tous les gymnospermes ne sont pas nécessairement des conifères. Le ginkgo bilobé est un bon exemple de cela, puisque celui-ci est un gymnosperme, mais qu'il ne fait pas de cônes. Aussi, les noms d'arbres ci-dessous sont classés en ordre alphabétique.